有很多人支持方舟子，包括一些自稱原本反感方舟子的人。
為聲援方舟子，8月30日，“反偽科學(xué)斗士”司馬南自稱“在悲憤狀態(tài)下急就”了一篇博文，稱“如果我是‘中國最大媒體’《感動(dòng)中國》的總導(dǎo)演樊馨蔓，看到這兩件同一天里發(fā)生的事，我會(huì)難過地閉上眼睛，摸著自己的良心真誠地反省，我會(huì)痛苦地承認(rèn)，此前判斷有誤，我會(huì)有鑒于這樣一個(gè)結(jié)果，將功補(bǔ)過力挺方舟子成為2010《感動(dòng)中國》候選人�！�
但是質(zhì)疑的聲調(diào)也一度很高。有媒體采訪武漢市協(xié)和醫(yī)院泌尿外科主任醫(yī)生肖傳國，他認(rèn)為方舟子遇襲一事很可疑，可能是在報(bào)假案、是在炒作。
自稱“《炒作學(xué)》開山鼻祖”的爭議作家張一一在微博中稱，方舟子最近將推出新書《諾亞方舟》，因此想學(xué)他當(dāng)年那樣自我策劃來做宣傳。
“沉默”中的方舟子還在“戰(zhàn)斗”。方舟子發(fā)微博回應(yīng)：“‘80后作家’張一一和大河網(wǎng)公然造謠，胡說我遇襲是自我炒作，是為了推出新書《諾亞方舟》。本人從來就沒有也不準(zhǔn)備出版一本什么《諾亞方舟》的書。本人的筆名和‘諾亞方舟’毫無關(guān)系。天底下竟然有如此喪盡天良的人和媒體！”
一些荒唐質(zhì)疑不該被“放”出來
至于以后是不是會(huì)對肖傳國、張一一等采取法律行動(dòng)，那得等這件事情過去之后我再跟律師商量”
現(xiàn)代快報(bào)：在你遇襲之后，還是有一些所謂的質(zhì)疑，幾天之后，你怎么看這些質(zhì)疑？
方舟子：這些質(zhì)疑里有一些是非�；奶频摹＿@些質(zhì)疑如果是一些匿名的人發(fā)出來的，在網(wǎng)上隨便說說也就算了，但有的是真名實(shí)姓的人寫出來的，而一些媒體還把這些純屬造謠污蔑的言論發(fā)表出來，這就很不正常了。對媒體來說，應(yīng)有基本的素養(yǎng)，在登出所謂的不同聲音之前，你應(yīng)該有一個(gè)起碼的判斷，而且也應(yīng)該調(diào)查一下。不能為了搞所謂的平衡，就把一件事搞得像很有爭議似的，然后把那些謠言放出來。
現(xiàn)代快報(bào)：在這些質(zhì)疑聲里，哪些真名實(shí)姓的人的話給你留下了最深的印象？
方舟子：比如說那個(gè)張一一，說我是為了炒作一本書才怎么樣怎么樣。
現(xiàn)代快報(bào)：而這本書是不存在的？
方舟子：他所說的書《諾亞方舟》根本就不存在。被我駁斥了之后，他又說我被他識破了之后為了避嫌把書名改成《大象為什么不長毛》�！洞笙鬄槭裁床婚L毛》這本書倒是有，但我這本書，在我被打的前幾天就出來了，在微博中把封面都貼出來了，哪是他說的那個(gè)原因。而且很早以前我在接受采訪的時(shí)候就說過要出這本《大象為什么不長毛》了。
現(xiàn)代快報(bào)：前幾日有媒體采訪武漢市協(xié)和醫(yī)院泌尿外科主任醫(yī)生肖傳國，他認(rèn)為你遇襲一事很可疑，可能是在報(bào)假案、是在炒作。當(dāng)然，很多網(wǎng)友并不認(rèn)同這種看法。對他和張一一的這些說法，你有沒有采取措施的打算？
方舟子：目前來說還沒有，我覺得這些是次要的事情，最重要的是協(xié)助警方破案，然后做好自己和家人的安全工作。至于以后是不是會(huì)對肖傳國、張一一，還有一些媒體采取什么法律行動(dòng)，那得等這件事情過去之后我再跟律師商量一下有沒有必要。
我理解家人顯得“脆弱”的擔(dān)心
本來這種擔(dān)心就一直存在，現(xiàn)在實(shí)際發(fā)生了，有時(shí)候感情會(huì)顯得脆弱一些”
現(xiàn)代快報(bào)：說到家人的安全，我剛剛看到一篇你愛人9月2日早上6點(diǎn)多寫的一篇博客文章《活著》，文章第一段就寫：今天是阿民被襲擊的第四天。四天來，我震驚過，欣慰過，悲哀過，狂怒過，現(xiàn)在我感到徹骨的荒涼，無邊無際的虛無。也許我不該這么說，因?yàn)橛心敲炊嗟闹袊嗽谥С址街圩樱曉街圩印瓘倪@段話能感覺出家人對你的擔(dān)心，也能感覺到一種令人揪心的東西。
方舟子：這個(gè)擔(dān)心是當(dāng)然的，這是可以理解的，本來這種擔(dān)心就一直存在，現(xiàn)在實(shí)際發(fā)生了，有時(shí)候感情會(huì)顯得脆弱一些。
現(xiàn)代快報(bào)：人大教授張鳴今年接受過快報(bào)的幾次專訪，他9月1日在《南方都市報(bào)》發(fā)表《方舟子不可能假借權(quán)勢傷人》一文，文章中有句話說得很好：方舟子有很多的擁躉，也有很多不喜歡他的人。對不喜歡的人、被人討厭的人容忍的程度，是一個(gè)社會(huì)是否文明的試金石。
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